Nature:肠道生物体代谢产物新功能,促进HDAC3酶活性

2022-01-31 05:24:52 来源:
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灵长目寄生虫和对其有益的常与病原体的主导演化导致了寄生虫-病原体的关系的发展。性状表达性状修饰使得灵长目线粒体并能整合外界环境频率,作出贡献线粒体对环境的适应性。但是一直以来常与的消化系统病原体方面联的多种频率闭环和多种环境频率是如何精密调控的还不甚可信。

消化系统滤泡毗邻病原体群和寄生虫错综复杂的界面,作出贡献不可或缺隔断的构成,在生活品质中期和破损中期对消化系统表皮同步进行补足。维持消化系统滤泡发挥作用过程之前有多种性状表达性状组态同步进行其之前,其之前HDACs的表述对于消化系统稳态并不不可或缺。消化系统病原体方面联的短链脂肪酸磺酸食盐(Butyrate)在体外消除HDAC活性,磺酸食盐管控后的消化系统民间组织滤泡之前HDAC活性下降。在杀菌狐之前植入产磺酸食盐的消化系统病原体但会消除消化系统滤泡之前HDAC的活性。这些结果都说明消化系统病原体方面联的磺酸食盐消除HDAC的活性。但是消化系统病原体与核糖;大烷基化选择性错综复杂的调控组态是怎样的还不得而知。

近来,美国圣路易斯公立医院医疗之前心Theresa Alenghat数据分析室在Nature新闻周刊上发表文章 Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut,找到消化系统病原体方面联的甘氨酸酰食盐并能通气消化系统内核糖;大烷基化酶HDAC3的活性从而作出贡献消化系统滤泡的复建,拉开序幕了寄生虫对于消化系统病原体频率响应的具体组态。

为了拉开序幕消化系统病原体衍生生物合成中间体与性状表达性状频率错综复杂的的关系,创作者们对野生改进型以及消化系统滤泡HDAC3敲除果蝇之前的HDAC活性进性扫描,找到野生改进型样本果蝇之前的HDAC3表述较长时间并且很强稳定的选择性,但是消化系统滤泡HDAC3敲除果蝇则相反。创作者们不想告诉他HDAC3确实但会抗体通气消化系统病原体敏感的频率其会。创作者们找到HDAC1与HDAC2在消化系统滤泡之前也有表述,但并必需补偿金消化系统滤泡之前HDAC3表述的局限性。而且在对杀菌狐和消化系统滤泡HDAC3敲除果蝇之前的消化系统滤泡除去HDAC广谱消除剂管控后,找到在HDAC3敲除后其他种类的HDACs仍然很强活性。这些结果说明消化系统病原体作出贡献滤泡之前HDAC3在较长时间消化系统稳态之前的选择性。

为了密码消化系统病原体激活HDAC3的具体组态,创作者们对杀菌狐和较长时间培育出的果蝇之前消化系统滤泡之前的转录谱同步进行验证。创作者们找到在消化系统病原体存在的滤泡之前与甘氨酸酰生物合成方面的性状被广泛应用其会表述。前人的数据分析找到甘氨酸三酰(Inositol trisphosphate)但会通过强化HDAC3与激活酶的相互不可或缺作用来减少HDAC3的活性。创作者们找到外加甘氨酸三酰的确但会抗体减少HDAC3-NcoR重核糖的活性,NcoR酶对于HDAC3的;大烷基化选择性并不不可或缺。

必要性地,创作者们不想告诉他杀菌狐与样本的果蝇消化系统错综复杂甘氨酸三酰水准确实存在差异性。创作者们找到样本果蝇之前无论是肠腔还是消化系统滤泡之前甘氨酸三酰的水准都纯着较低杀菌狐,说明消化系统病原体的存在作出贡献甘氨酸三酰水准的减少。为了统计分析报告甘氨酸三酰对于消化系统滤泡之前HDAC3活性的影响,创作者们对消化系统滤泡之前的HDAC3酶同步进行纯化并与甘氨酸三酰同步进行主导孵卵,找到甘氨酸三酰的确并能减少内源HDAC3的活性。而且磺酸亚胺造成的HDAC3活性的消除也可以被甘氨酸三酰所骨骼肌。另外,创作者们还找到常与的消化系统病原体但会通过甘氨酸六酰(Phytate)生物合成途径作出贡献消化系统滤泡之前的HDAC3的组态。与甘氨酸三酰相似,甘氨酸六酰也但会其会消化系统滤泡之前的HDAC3的活性。

为了扫描消化系统病原体甘氨酸六酰相反的生物合成对于HDAC活性的影响,创作者们对定植野生改进型以及甘氨酸六酰酶局限性改进型病原体的果蝇同步进行统计分析。创作者们找到定植甘氨酸六酰酶较长时间表述病原体的果蝇整体而言于杀菌狐以及甘氨酸六酰局限性改进型病原体果蝇的甘氨酸三酰水准升高。对果蝇同步进行右旋糖酐亚胺钠(Dextran sodium sulfate, DSS)管控后,但会其会果蝇显现出消化系统结核病。为了扫描甘氨酸三酰在DSS管控其会的消化系统结核病之前的不可或缺作用,创作者们对杀菌狐除去甘氨酸三酰后找到甘氨酸三酰并能作出贡献消化系统从结核病之前恢复并减少杀菌狐的寿命。DSS其会的胆管癌十分相似产妇之前溃疡性胆管癌。为了必要性确认消化系统病原体生物合成中间体的组态,创作者们对人类整合病原体组学计划书(Integrative Human Microbiome Project)之前的生活品质抽样以及溃疡性胆管癌患者的样品同步进行扫描,找到在溃疡性胆管癌产妇消化系统之前甘氨酸六酰酶的数量级远低于生活品质抽样之之前,说明甘氨酸六酰对于消化系统破损复建是必需的。

总的来说,Alenghat数据分析室的工作找到整体而言于杀菌狐,消化系统病原体存在的果蝇之前HDAC3活性纯着增加,这一增加是通过常与的消化系统病原体比如病原体甘氨酸六酰以及甘氨酸三酰的生物合成构成的。另外,甘氨酸三酰但会其会产妇方面联的消化系统类器官的生长、诱发HDAC3相反的表征以及骨骼肌磺酸亚胺引致的消化系统生长消除,但会作出贡献消化系统结核病之前滤泡的复建。因此,创作者们鉴定找到了HDAC3作为寄生虫响应多种消化系统病原体频率的汇聚性状表达性状因子的极其重要组态,拉开序幕了消化系统病原体、性状表达性状因子以及病原体生物合成中间体在消化系统表皮以及消化系统结核病之前的极其重要调控和复建不可或缺作用。

原始出处:

Shu-En Wu, Seika Hashimoto-Hill, Vivienne Woo, et al.Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut.Nature. 2020 Jul 30. doi: 10.1038/s41586-020-2604-2.

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